Heidi es una niña huérfana que vive en los Alpes junto a su abuelito. Es feliz jugando con su perro, las cabritas y su amigo Pedro, pero un día tiene que abandonar sus queridas montañas. Heidi se traslada a vivir a Fráncfort para ser la compañera de juegos de Clara, una niña que no puede andar. También tendrá que tener mucho cuidado con la señorita Rottenmeier, la institutriz de Clara, que le hará la vida imposible con sus estrictas reglas.
La vida en la ciudad desagrada tanto a Heidi que empieza a sentir una profunda nostalgia por su abuelo, las montañas y sus amigos, por lo que los médicos deciden que vuelva a sus amadas montañas. Tras un tiempo, Clara siente lo mismo a causa de su precipitada separación de Heidi, y también emprende su viaje hacia las montañas. Tras un tiempo y gracias a los cuidados de su mejor amiga, Heidi, Clara incluso conseguirá ponerse en pie y andará de nuevo.